Детективный фильм «Тайное происхождение» - это история таинственного серийного убийцы, который шокирует жителей Мадрида нестандартными преступлениями. Неизвестный маньяк убивает своих жертв так, будто эти преступления совершают суперзлодеи из комиксов и фильмов. Расследовать дело поручают молодому полицейскому Давиду, который совсем недавно перевелся в столицу из провинциального городка и известен своим нестандартным мышлением. Чтобы раскрыть дело, Давид решает обратиться к Хорхе Элиасу, который владеет небольшим магазином комиксов и знает абсолютно все о супергероях и суперзлодеях. Вдвоем они пытаются предугадать, как преступник поступит в следующий раз. Однако молодой коп еще не знает, что однажды ему придется надеть костюм супергероя, чтобы один на один сразиться с преступником.