Действие сериала «Алхимия душ» разворачивается в фэнтезийном мире, который называется Дэхо. Там живет молодой мастер боевых искусств Чан Ук, у которого есть большая тайна. Во всей стране Дэхо нет такого человека, который бы не знал, кто такой Чан Ук – он не просто талантливый боец, а лучший из лучших. Однажды парень знакомится с утонченной красавицей Му Док, в которую он влюбляется. Именно эта девушка становится его самой большой тайной. Оказывается, что это искусная наемная убийца, душа которой из-за магии оказалась в слабом теле. Вот только главный герой не знает самого главного – последним заданием Му Док было убить его.