Главные герои фильма «Два капитана» – двенадцатилетние школьники Сережа и Агван, которые дружат с первого класса. Отцы ребят в детстве тоже были лучшими друзьями, но однажды папа Сережи стал предателем, что навсегда перечеркнуло дружбу. Отец Агвана Андрей стал полицейским, который честно выполняет работу, отправляя преступников одного за другим в тюрьму. А вот отец Сережи оказался по другую сторону закона, первый раз он отсидел за воровство, второй раз – за убийство. Спустя много лет друзья детства снова встречаются, когда рецидивист обращается за помощью к полицейскому. Сережа исчез и его надо найти...