Главный герой детективного сериала «Операция «Кукловод»» – майор ФСБ Иван Королев, который служит много лет и прекрасно умеет действовать незаметно. Однако новая миссия по задержанию международного торговца оружием оборачивается катастрофой, когда группа попадает в засаду, операция проваливается, а сам Королев оказывается в эпицентре политического заговора. В такой ситуации врагом может оказаться любой, даже лучший друг. Пока ведомство ищет виновных, Королев начинает собственное расследование и выходит на след кукловода, который манипулирует не только представителями криминала, но и высокопоставленными чиновниками. Главный герой понимает, что разоблачить кукловода – значит бросить вызов системе, что может стоить ему жизни.