Мультфильм «Тайна третьей планеты» рассказывает о приключениях девочки Алисы в космосе. Вместе с немного рассеянным папой-ученым, опытным бесстрашным космонавтом Зеленым и несколькими инопланетными друзьями, девочка путешествует от планеты к планете, попадает в разные истории, делает добрые дела, узнает что-то новое.