События исторического сериала «Гугеноты» разворачиваются во Франции в середине шестнадцатого века и рассказывает о судьбе знатного рода Сьорак. Жан де Сьорак является рыцарем и убежденным протестантом, поэтому всеми силами старается защитить близких и свою общину от преследований, которые устраивает католическая церковь. При этом католиков поддерживает лично король. Его супруга Изабель, напротив, остается верной католической вере и вынуждена искать баланс между собственными убеждениями и выбором мужа, приспосабливаясь к стремительно меняющемуся миру. Их сыновья, Пьер и Франсуа, взрослеют в условиях расколотой семьи и страны, где религиозные конфликты требуют от них непростого выбора. Молодые люди вынуждены выбирать между верой, долгом перед страной и семейными узами. Главные герои становятся свидетелями преследований гугенотов, публичных казней и ожесточенных конфликтов между католиками и протестантами.